BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB034B09LP1|AL429860
(857 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
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>3x_Contig894
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>3x_Contig1614
Length = 4869
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Query: 661 atagattgcaa-tactgagacgttcgaacttcgagagttcgagagtgtgctgttgtctct 719
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Query: 720 gtgacagacttcgtctctctcgaccggttgatgatttacaggtgcacaattaccagttgc 779
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Query: 780 agagggaaacatgtgaaaggccttcctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcag 839
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>3x_Contig1164
Length = 2302
Score = 1335 bits (673), Expect = 0.0
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Query: 61 aagctcaatccccc-aatggcagcatagtcgagtttacctccagtttcgtattttccact 119
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Query: 120 atccatgtaatatgacaagtaaacaccgtaaccatacgacgcaccagaggygagnaagtt 179
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Query: 180 taacaagaaggatgagaaaaccaccacccagccatagcctccatctggaacttttatttt 239
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Sbjct: 2074 taacaagaaggatgagaaaaccaccacccagccatagcctccatctggaacttttatttt 2015
Query: 240 gttgtagctatcatcctcatcttctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctcctt 299
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Sbjct: 2014 gttgtagctatcatcctcatcttctggcacagtctcaaattcataaatagtttgctcctt 1955
Query: 300 ttcgagtctgccaggatctttcaattctcctgctgaagaaatgtttgaagtttccaagct 359
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Sbjct: 1954 ttcgagtctgccaggatctttcaattctcctgctgaagaaatgtttgaagtttccaagct 1895
Query: 360 ggtagcggcctctcctttctctctgaaggtagtattattctcggacatgatgctctgaag 419
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Query: 420 agttgcactcattcaagttgtccgaggttgtaaagataaaaactgaccgtgaagtatccc 479
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Query: 480 gtcagttggtgtgcaacgtcagattctttagaggtatatttatatgtttccaggttaaga 539
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Sbjct: 1714 aaaaagaagaaaatacataccaacaggagtagaatcaaaagagatagagtcaaaatttgt 1655
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Sbjct: 1482 cagagggaaacatgtgaaaggccttcctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgca 1423
Query: 839 gtcgtgttgtcaagttcta 857
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Sbjct: 1422 gtcgtgttgtcaagttcta 1404
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of successful extensions: 62
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effective search space used: 8687226399
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.7 bits)